Toimitusjohtaja
Yhtiön toimitusjohtajan nimittää hallitus. Toimitusjohtajan tehtävänä on hoitaa konsernin juoksevaa hallintoa osakeyhtiölain ja hallituksen antamien ohjeiden ja määräysten mukaisesti. Toimitusjohtaja ei saa ryhtyä yhtiön toiminnan laatu ja laajuus huomioon ottaen epätavallisiin tai laajakantoisiin toimiin muutoin kuin hallituksen suostumuksella. Toimitusjohtajaa avustaa toimessaan konsernin johtoryhmä.
Stonesoft Oyj:n toimitusjohtajana on toiminut 3.8. 2004 lähtien yrityksen perustaja Ilkka Hiidenheimo.
Toimitusjohtajan kompensaatio
Toimitusjohtaja Ilkka Hiidenheimo ei ole ottanut vastaan palkkaa tai muuta korvausta tehtävistään vuoden 2012 aikana. Toimitusjohtajalle ei ole määritelty erityistä eläkeikää. Toimitusjohtajan eläke on sama työeläke (TYEL) kuin kaikilla Stonesoftin työntekijöillä. Toimitusjohtajan sopimuksessa on määritelty kuuden kuukauden irtisanomisaika. Irtisanomiskompensaatioksi on määritelty kuuden kuukauden palkkaa vastaava korvaus. Sopimuksessa on lisäksi kuuden kuukauden palkkaa vastaava lisäkorvaus, mikäli yhtiön irtisanoo sopimuksen ilman toimitusjohtajan sopimusrikkomusta.
Toimitusjohtajalle on myönnetty optio-oikeuksia, yhteensä 70 000 kappletta optio-ohjelmasta 2008 ja 140 000 kappaletta optio-ohjelmasta 2012.